Quel logiciel de gestion des factures fournisseurs choisir pour son entreprise ?

Traiter, valider, archiver et payer ses factures fournisseurs, autant de tâches qui sont à la fois indispensables et chronophages. Pour gagner en efficacité et sécuriser vos paiements, vous pouvez toutefois adopter un logiciel de gestion des factures fournisseurs. Tour d’horizon des meilleurs outils pour automatiser vos processus et garder le contrôle sur vos dépenses.

Un logiciel de gestion des factures fournisseurs est une solution digitale qui automatise l'ensemble du cycle de vie des factures entrantes, de leur réception jusqu'à leur paiement et leur archivage.

Cet outil permet de :

• centraliser les factures ;
• extraire automatiquement les données grâce à la technologie OCR (reconnaissance optique de caractères) ;
• fluidifier les circuits de validation.

Il s’inscrit pleinement dans une logique de dématérialisation des factures fournisseurs, en remplaçant les traitements papier et les saisies manuelles par des flux numériques sécurisés et traçables.

Un logiciel de gestion des factures fournisseurs offre plusieurs avantages. Par exemple :

• détection des doublons et des erreurs ;
• traçabilité des factures ;
• rapprochement facilité avec les bons de commande et de livraison ;
• automatisation des contrôles de conformité ;
• préparation des écritures comptables pour un export vers le logiciel de comptabilité.

Il permet également de répondre aux obligations légales qui concerneront toutes les entreprises, avec l’entrée en vigueur de la réforme sur la facturation électronique.

En effet, il faudra passer par une Plateforme Agréée (anciennement plateforme PDP) pour émettre et réceptionner des factures électroniques à compter du 1er septembre 2026.

Voici une sélection des meilleurs logiciels de gestion des factures fournisseurs disponibles sur le marché :

• Qonto ;
• N2F Factures fournisseurs ;
• Lucca ;
• Proactis ;
• Agicap ;
• Libeo.

Qonto propose une solution complète qui combine :

• compte professionnel rémunéré ;
• solution de cash management ;
• tableau de bord personnalisable ;
• facturation des clients ;
• outil de gestion des factures fournisseurs.

Certifiée Plateforme Agréée pour la facturation électronique, notre solution permet de centraliser toutes vos factures dans une interface intuitive et de suivre vos flux de trésorerie en temps réel.

Le logiciel de gestion des factures fournisseurs de Qonto présente de véritables atouts :

• détection automatique de la TVA et des éléments essentiels de vos factures grâce à l’OCR ;
• rapprochement des factures aux transactions correspondantes ;
• suivi des échéances à venir pour éviter les retards et les pénalités ;
• programmation des virements pour payer les fournisseurs sans délai ;
• accès à des solutions de financement avec options de remboursement flexibles.

Qonto vous permet également de déléguer la gestion de vos factures fournisseurs à vos collaborateurs et de simplifier votre pré-comptabilité avec la réconciliation automatique et un accès comptable.

N2F Factures fournisseurs est un logiciel spécialisé dans l'automatisation du workflow de traitement des factures.

La solution se distingue par :

• son OCR intelligent qui récupère automatiquement les données des factures, qu'elles soient au format PDF, image, Factur-X ou UBL ;
• la détection automatique des erreurs, doublons et risques de fraude ;
• la possibilité de créer des demandes d’achat avant la réception des factures ;
• l’automatisation du circuit d’approbation des factures ;
• la traçabilité de bout en bout des factures fournisseurs avec un horodatage certifié et un archivage réglementaire.

N2F s'exporte vers plus de 300 logiciels de comptabilité et peut convenir à tout type d’entreprise.

Lucca est un logiciel de gestion des factures fournisseurs qui centralise les factures récupérées automatiquement via sa Plateforme Agréée et celles qui ont été déposées par un collaborateur ou reçues par mail.

L’outil utilise la technologie OCR pour extraire automatiquement les informations clés des factures fournisseurs (montants, ventilation par ligne, etc.). Leur traitement devient quasi-instantané, réduisant le temps consacré aux tâches à faible valeur ajoutée.

Lucca permet aussi de :

• gérer les notes de frais de l’entreprise ;
• paramétrer un circuit d’approbation ;
• automatiser les exports comptables.

La solution propose également un compte de paiement intégré qui permet de régler directement les factures fournisseurs depuis le logiciel, avec la possibilité de générer des cartes virtuelles à usage unique.

Proactis automatise le traitement des factures fournisseurs, de leur réception jusqu'à leur paiement.

La solution propose :

• le rapprochement automatique des factures et des demandes d’achat existantes ;
• la numérisation des documents papier et PDF ;
• l’extraction des données des factures pour éliminer la saisie manuelle et réduire le risque d’erreur ;
• une interface intuitive pour améliorer la productivité des équipes et l’adoption des processus.

Proactis permet également de paramétrer des workflows de validation personnalisés et d'automatiser la génération des écritures comptables.

Attention, Proactis n’est pas une Plateforme Agréée par l’État.

Agicap propose une plateforme complète de gestion des dépenses et du poste fournisseurs. La solution, certifiée Plateforme Agréée, centralise l'ensemble du processus d'achat dans un environnement unique.

Avec ce logiciel, vous pouvez :

• créer des demandes d’achat ;
• recevoir vos factures via la Plateforme Agréée ou par mail ;
• extraire les informations clés grâce à l’OCR d’Agicap ;
• payer directement les factures fournisseurs ;
• préparer votre pré-comptabilité.

Plus largement, Agicap vous permet de garder le contrôle sur les dépenses de votre entreprise et d’automatiser la gestion de vos factures tout en améliorant la précision de vos suivis de trésorerie.

Libeo vous permet d’automatiser l’ensemble du processus de paiement des factures fournisseurs, de la réception des documents jusqu’au virement.

L’outil offre de nombreux avantages :

• l’extraction automatique des données par OCR pour réduire les risques d’erreurs et de fraude ;
• la centralisation des informations fournisseurs dans un catalogue complet ;
• la possibilité de réaliser ses paiements directement depuis Libeo ;
• la programmation des paiements pour garder la maîtrise de sa trésorerie d’entreprise.

Libeo collecte et traite les factures électroniques émises par vos fournisseurs via une Plateforme Agréée partenaire. Elle bénéficie également d’intégrations vers les principaux outils comptables du marché.

L’utilisation d’un logiciel de gestion des factures fournisseurs présente plusieurs avantages :

• un gain de temps considérable : les tâches de saisie, de vérification et de classement sont automatisées ;
• la réduction des fautes de frappe, des oublis et des incohérences grâce à l’extraction automatique des informations des factures ;
• la sécurité financière de l’entreprise grâce à la détection des fraudes ;
• le suivi de la trésorerie : les factures à payer et les dates d’échéance sont visibles en un coup d’oeil ;
• l’amélioration des relations fournisseurs grâce à des paiements réalisés dans les temps ;
• l’automatisation de la comptabilité fournisseurs, les écritures comptables étant générées et exportées directement vers le logiciel de comptabilité.

De même, la conformité réglementaire est assurée avec une solution de dématérialisation des factures fournisseurs. Cet outil assure une piste d'audit fiable avec traçabilité complète de chaque action.

Commencez par évaluer le volume de factures fournisseurs qui sont traitées chaque mois. En effet, une TPE avec quelques dizaines de factures n'a pas les mêmes besoins qu'une PME gérant plusieurs centaines de documents par mois.

Certaines solutions proposent des tarifs évolutifs selon le volume de factures à gérer, d'autres offrent un stockage et un traitement illimités.

De même, les fonctionnalités de validation doivent correspondre aux besoins de votre organisation. Vérifiez également la compatibilité du logiciel avec les outils déjà utilisés en interne. Une bonne intégration évite les ressaisies et garantit la cohérence des données.

Les modalités de paiement proposées sont aussi à prendre en compte. Certains logiciels se limitent à la préparation des virements que vous devrez ensuite exécuter depuis votre banque. D'autres permettent de payer directement depuis la plateforme, avec programmation des paiements et virements instantanés.

Bien sûr, le coût total du logiciel doit être évalué au-delà du seul abonnement mensuel. Intéressez-vous aux frais de mise en place et de formation, aux coûts par transaction ou par facture traitée, et aux éventuels modules additionnels.

Enfin, la conformité à la réglementation devient incontournable avec la réforme de la facturation électronique. Privilégiez une solution certifiée Plateforme Agréée, comme le logiciel de gestion des factures fournisseurs de Qonto, qui vous permet de recevoir et d'émettre des factures électroniques dès aujourd’hui.

Les informations mentionnées dans cet article sur la comparaison des logiciels de gestion des factures fournisseurs ont été rassemblées après une recherche approfondie sur les sites web des fournisseurs respectifs en février 2026 et en toute bonne foi. Qonto n'est pas responsable de l'exactitude complète de toutes les informations, car les prix et les services peuvent changer au fil du temps. Nous faisons de notre mieux pour que toutes les informations soient toujours à jour. Nous vous invitons toutefois à vous informer par vous-même avant de prendre une décision finale.