ERP pour PME : le guide complet pour choisir le bon progiciel

Pour les PME, le pilotage efficace de leur activité repose sur des outils performants et centralisés. C’est là qu’intervient l’ERP. Grâce à ce progiciel de gestion intégré, les PME peuvent automatiser, structurer et fluidifier la gestion quotidienne de leurs activités commerciales et logistiques : comptabilité, facturation, stocks, ressources humaines, production, etc. Face à la diversité des offres sur le marché, découvrez comment choisir votre ERP et appuyez-vous sur notre comparatif pour trouver celui qui répondra à vos besoins.

Un ERP (pour Enterprise Resource Planning) est un logiciel qui permet de centraliser l’ensemble des données et des processus de gestion d’une PME (comptabilité, ventes, achats, stocks, production, facturation, etc.) au sein d’une base de données unique.

Il offre ainsi de nombreuses solutions d’automatisation.

À titre d’exemple : si le service commercial crée un devis, il peut automatiquement générer la commande, la mise à jour du stock, la facture et l’écriture comptable grâce à l’ERP. Aucune saisie manuelle n’est nécessaire.

Dans une PME, l’ERP joue un rôle pivot. Il permet de :

• limiter les erreurs humaines ;
• gagner du temps sur les tâches administratives ;
• avoir une vision globale et en temps réel de l’activité.

Les ERP destinés aux PME ont généralement une architecture modulaire afin que les sociétés puissent ne prendre que les fonctionnalités dont elles ont besoin pour leur développement.

Pour compléter votre ERP, Qonto vous propose un logiciel de facturation électronique 100 % gratuit. Il est totalement conforme à la nouvelle réforme de la facturation électronique puisque Qonto est immatriculée en tant que plateforme de dématérialisation partenaire (PDP).

Vous pourrez ainsi émettre en quelques clics des factures au format Factur-X et centraliser vos factures fournisseurs.

Vous voulez aller plus loin ? Notre plateforme tout-en-un combine facturation, compte pro et pré-comptabilité. Une solution idéale pour optimiser votre gestion administrative et financière.

Il existe une grande variété d’ERP pour PME. Ils peuvent être classés en quatre catégories. À savoir :

• les ERP cloud et SaaS ;
• les logiciels open source ;
• les logiciels on-promise ;
• les ERP métiers.

Les ERP cloud ou SaaS (software as a service) sont directement hébergés sur des serveurs.

La PME y accède via une simple connexion internet.

Cette option ne nécessite pas une infrastructure informatique lourde : vous pouvez vous y connecter depuis n’importe quel appareil connecté à Internet. Ces logiciels offrent plus de flexibilité et de mobilité.

Par ailleurs, vous n’avez pas à vous soucier de la maintenance, ni des mises à jour.

Les ERP cloud ou SaaS reposent sur un tarif sous forme d’abonnement, sans investissement initial.

Les ERP open source sont des logiciels dont le code est accessible et modifiable librement.

Ce modèle permet une forte personnalisation, prisée par les PME ayant des besoins spécifiques ou des compétences techniques internes.

Ces logiciels sont gratuits, mais la mise en œuvre, le paramétrage et la maintenance nécessitent d’avoir une équipe informatique interne ou externe.

À l’inverse des logiciels cloud qui sont hébergés sur des serveurs, les solutions on-promise (ou sur site) sont installées en interne.

Cette solution est plus onéreuse puisque vous devez acheter la licence et une infrastructure informatique propre.

Par ailleurs, vous devenez responsable de sa maintenance, de ses mises-à-jour et du support. Il faut obligatoirement une équipe informatique dans la PME.

De plus, ces systèmes sont généralement moins modulables.

Contrairement aux ERP généralistes, les ERP métiers sont développés spécifiquement pour un secteur d’activité : bâtiment, hôtellerie, transport, agroalimentaire, etc.

Ils intègrent ainsi des fonctionnalités prêtes à l’emploi.

Ces logiciels sont généralement utilisés par les PME ayant un secteur très normé ou ayant de lourdes exigences opérationnelles.

Pour améliorer la gestion financière d’une PME, il est également important que tous ses outils puissent travailler ensemble.

Qonto se connecte à tous vos outils ERP via EBICS. Vous pourrez ainsi :

• automatiser la collecte de vos documents pour profiter de la réconciliation bancaire (le rapprochement automatique des transactions) et gagner du temps sur vos opérations de pré-comptabilité ;
• obtenir des informations financières cohérentes, fiables et instantanées ;
• exporter vos données ;
• payer vos factures directement depuis l’ERP.

Parmi les logiciels ERP du marché, certains se distinguent par leurs fonctionnalités pensées pour les besoins spécifiques des PME et d’autres proposent des solutions modulaires et personnalisables.

Huit progiciels se démarquent. À savoir :

• SAP Business One ;
• Microsoft Dynamics 365 ;
• Odoo ;
• Sylob ;
• Abas ;
• Incwo ;
• Jeboostemaboite ;
• NetSuite.

Qonto n’est pas un ERP, mais un compte pro tout-en-un avec de nombreuses fonctionnalités de gestion financière.

Déclinaison PME du géant SAP, SAP Business One est un ERP robuste qui propose une couverture fonctionnelle large pour la gestion :

• des ventes et de la clientèle (création des campagnes marketing, gestion des contrats, élaboration de reporting, etc.) ;
• des achats et des stocks (rationalisation des processus d’approvisionnement, synchronisation des entrées de marchandises et des niveaux de stocks, planification des besoins, etc.) ;
• des finances (automatisation des écritures au journal, gestion de vos flux de trésorerie, gestion de vos immobilisations, etc.).

Il s’adapte aussi bien aux secteurs industriels que commerciaux.

Il peut être déployé en local ou en cloud et propose des modules supplémentaires (biens de grande consommation, production, services professionnels, retail, etc.) pour la production, la gestion commerciale et la comptabilité.

Flexible et modulaire, Microsoft Dynamics 365 combine ERP et CRM dans une solution cloud basée sur l’IA.

Ce logiciel permet aux PME de prendre des décisions optimales grâce à l’obtention de données en temps réel et à l’intégration de l’IA que ce soit pour gérer les opérations de vente, de service, de stocks ou de finance.

Il offre de nombreuses automatisations (par exemple, pour la notation de prospect, la gestion des contrats, le suivi des projets, etc.).

Un avantage est qu’il se connecte à de nombreux outils du quotidien (Copilot, Teams, Outlook, etc.).

ERP open source par excellence, Odoo séduit les PME grâce à sa grande modularité et à son interface intuitive.

Tout est personnalisable dans sa suite d’outils de gestion d’entreprise (plus de 40 000 applications communautaires). Ses principaux modules sont :

• finance ;
• ventes et CRM ;
• marketing ;
• e-commerce ;
• inventaire ;
• ressources humaines ;
• projets ;
• productivité.

Ce logiciel propose une version communautaire gratuite et une version entreprise plus complète.

Spécialisé dans l’industrie, Sylob propose des ERP conçus pour les PME industrielles (aéronautique, automobile, électronique, dispositif médical, etc.).

Ses modules couvrent :

• les ventes et les affaires ;
• la production et la planification ;
• la gestion financière et le pilotage ;
• la supply chain.

Il propose également une interopérabilité remarquable avec les outils métiers.

Abas ERP est orienté vers les PME industrielles avec un fort besoin d’intégration logistique et de gestion de la production (dont des outils d’évaluation et de calcul des coûts).

Sa force réside dans sa capacité à s’adapter aux spécificités métiers (notamment à l’export), et dans la possibilité d’apporter des ajustements aux fonctionnalités soi-même.

Il comprend un grand nombre de fonctionnalités incluses dans un package complet intégré à l’ERP.

Solution SaaS française, Incwo est pensé pour les entrepreneurs et les dirigeants de PME.

L’outil est particulièrement apprécié pour sa simplicité de prise en main et sa large palette fonctionnelle (CRM, facturation, gestion des stocks, catalogue produit, RH, pré-comptabilité, compte pro, indicateurs de trésorerie , etc.).

Il vous donne également accès à l’automatisation de vos workflows de production.

L’IA intégrée vous permet d’améliorer votre développement commercial grâce à des résumés d’activité et des plans d’actions.

Enfin, Incwo est totalement personnalisable avec plus de 400 applications et connecteurs.

Destiné aux TPE et PME, Jeboostemaboite propose une seule formule avec toutes les fonctionnalités incluses à 59,90 € HT par mois.

Le logiciel couvre des besoins très variés, du CRM à la gestion de stock en passant par la création de sites, la mise en place d’une campagne marketing et le traitement des factures.

Son but est de vous faire gagner du temps, de renforcer votre visibilité et de fidéliser vos clients.

Développé par Oracle, NetSuite est un ERP cloud complet pour les entreprises en croissance, notamment celles opérant à l’international. Il est présent dans plus de 219 pays.

Il vous permet de suivre toutes les activités de votre PME, et comprend notamment la gestion de la multi-devise, des filiales et des reportings consolidés.

Ses objectifs sont de :

• réduire votre clôture financière de plus de 50 % ;
• accélérer le processus d’order-to-cash (le traitement des commandes clients) pour améliorer l’expérience client et les délais de paiement ;
• perfectionner vos prises de décisions avec des données en temps réel, des rapports d’analyse et des tableaux de bord personnalisés ;
• optimiser la productivité de votre main d’œuvre.

Qonto n’est pas un ERP, mais un compte pro 100 % en ligne avec des fonctionnalités utiles pour la gestion quotidienne de votre entreprise, dont :

• un tableau de trésorerie interactif ;
• le calcul de l’estimation de la TVA en temps réel ;
• la gestion et le suivi des dépenses et des notes de frais ;
• un logiciel de facturation électronique ;
• la gestion multi-devises ;
• des intégrations API ;
• l’agrégation de comptes externes ;
• et bien plus encore.

Notre offre adaptée aux PME débute à 99 € HT par mois. Elle a été pensée pour vous faire économiser de nombreuses heures de gestion : jusqu’à 10 heures par mois selon l’étude Total Economic Impact réalisée en 2025 par Forrester Consulting.

Adopter un ERP dans une PME, c’est faire le choix d’un pilotage plus rigoureux et plus fluide. Les bénéfices pour l’entreprise sont nombreux. Par exemple :

• gain de temps : un ERP propose généralement de nombreuses automatisations afin de réduire les saisies manuelles et les éventuelles erreurs liées ;
• amélioration de la productivité : vos équipes ont accès aux mêmes données actualisées en temps réel et elles profitent de l’automatisation des processus métiers ;
• meilleure prise de décision : grâce aux tableaux de bord personnalisés, aux indicateurs de performance et aux informations consolidées, vous êtes à même de prendre des décisions éclairées au bon moment ;
• conformité réglementaire : les solutions ERP sont à jour des normes fiscales, sociales et sectorielles vous garantissant ainsi le respect des règles en vigueur.

Souvent les PME font l’erreur de prendre un logiciel pour chaque besoin : logiciel de notes de frais, solution pour la comptabilité, etc. Or, si les outils ne sont pas connectés entre eux, les informations sont difficilement accessibles ce qui peut entraîner des erreurs.

Un bon ERP est la solution idéale puisqu’il centralise la gestion de toutes vos données.

Vous êtes également à la recherche de la meilleure banque pour votre PME ? Qonto n’est pas une banque, mais un établissement de paiement qui a fait le choix de développer un compte pro accompagné d’outils de gestion (pré-comptabilité, trésorerie, gestion financière, facturation, etc.).

Par ailleurs, Qonto se connecte avec vos autres logiciels. Vous pourrez ainsi accéder à toutes vos informations dans une interface unique et intuitive.

Cinq points doivent être regardés avec minutie avant de souscrire un contrat avec un éditeur d’ERP. À savoir :

• les secteurs d’activité pris en charge par le logiciel ;
• les fonctionnalités proposées ;
• la qualité de l’expérience utilisateur ;
• les coûts de l’ERP ;
• l’accompagnement offert.

Certains progiciels de gestion intégré s’adressent à toutes les PME alors que d’autres se sont spécialisés dans certains secteurs ou métiers.

Les ERP généralistes offrent souvent une grande palette de fonctionnalités, certaines qui ne vous serviront pas forcément et d’autres qui nécessiteront une adaptation à vos processus métiers.

En revanche, les logiciels spécialisés à un domaine d’activité sont des solutions prêtes à l’emploi et proposent des services totalement adaptés à votre activité et à ses exigences.

L’ERP sélectionné doit offrir les modules nécessaires à votre fonctionnement : achats, ventes, facturation, CRM, comptabilité, gestion de projet, etc.

Il peut être utile d’établir un cahier des charges pour énumérer vos attentes (modules, nombre d’utilisateurs, application mobile pour les équipes sur le terrain, etc.).

Les solutions flexibles et modulaires ont une grande capacité de personnalisation ce qui permet de monter en gamme facilement pour accompagner la croissance de votre société.

Par ailleurs, un bon ERP doit s’adapter à votre organisation et à vos processus métiers. Il faut qu’il soit en mesure d’assurer une bonne gestion des flux d’informations entre vos services.

À l’inverse, ne prenez pas des fonctionnalités inutiles.

L’interface doit être claire, intuitive et accessible aux non-informaticiens afin d’avoir une prise en main rapide.

Un logiciel agréable à utiliser favorise l’adhésion des équipes et évite les blocages au quotidien.

Le prix d’un ERP varie fortement en fonction des fonctionnalités et de la spécialisation offerte. Par exemple :

• pour un ERP open source : gratuit ou plusieurs milliers d’euros pour une personnalisation de l’outil ;
• pour un ERP SaaS : un abonnement mensuel qui débute à une dizaine d’euros par utilisateur ;
• pour un ERP métier : à partir de 80 € par mois ;
• pour un ERP on-promise (local) : investissement initial lourd (environ 6 000 € par utilisateur).

Néanmoins, il faut aussi prendre en compte l’achat de modules supplémentaires et les coûts de formation, d’intégration et de maintenance.

Un système ERP est un investissement à moyen et long terme.

Un bon éditeur ou intégrateur doit vous accompagner sur le long terme : conseils en amont, migration de données, formation des utilisateurs, support technique, etc.

Un projet ERP ne se limite pas à une installation.

Pensez à vous renseigner sur :

• la disponibilité et la réactivité du service client ;
• l’ancienneté de l’éditeur ;
• sa santé financière ;
• sa stabilité organisationnelle ;
• sa capacité d’innovation (rythme des mises à jour, évolutions majeures, etc.).

Une entreprise utilise généralement un ERP pendant au moins dix ans.

Par ailleurs, l’éditeur doit assurer la sécurisation de vos données. Vérifiez la qualité des serveurs et si l’accès au back-office est contrôlé.

Et si vous commenciez par le compte pro tout-en-un de Qonto ? Bien plus que des moyens de paiement et d’encaissement, il offre de nombreux services de gestion (outils de facturation, de gestion des dépenses, de trésorerie, de pré-comptabilité, etc.) et une connectivité à tous vos logiciels grâce à EBICS.

Avec Qonto, la gestion financière de votre entreprise est facilitée. Vous avez connaissance de vos informations clés à chaque instant dans une interface intuitive et collaborative.

Les informations mentionnées dans cet article sur la comparaison des ERP ont été rassemblées après une recherche approfondie sur les sites web des fournisseurs respectifs en juillet 2025 et en toute bonne foi. Qonto n'est pas responsable de l'exactitude complète de toutes les informations, car les prix et les services peuvent changer au fil du temps. Nous faisons de notre mieux pour que toutes les informations soient toujours à jour. Nous vous invitons toutefois à vous informer par vous-même avant de prendre une décision finale.