Logiciel de facturation : comparatif, avantages et conseils pour bien choisir

La facturation est un passage obligé pour toutes les entreprises, que vous soyez indépendant ou à la tête d’une société. Pourtant, entre les obligations légales, le suivi des paiements et la gestion de la TVA, établir des factures peut vite devenir complexe et chronophage. Heureusement, les logiciels de facturation permettent d’automatiser une grande partie du processus, tout en garantissant la conformité des factures. Appuyez-vous sur notre guide pour trouver un outil adapté à votre activité.

Utiliser un logiciel de facturation n’est plus seulement un gain de temps précieux, c’est aussi une nécessité pour rester conforme et compétitif. En effet, il offre un meilleur suivi de trésorerie et une collaboration comptable facilitée.

Fini les tableurs manuels et les modèles Word, un bon logiciel de facturation automatise la création et l’envoi de factures.

En quelques clics, vous générez un document professionnel, conforme et prêt à être transmis à votre client.

Certains outils vont même plus loin : ils permettent d’envoyer des relances automatiques, de suivre vos paiements en temps réel et d’intégrer les données directement dans votre comptabilité.

Qonto Facturation est une de ces solutions.

Son logiciel de facturation gratuit et illimité vous fera gagner de nombreuses heures par mois puisqu’il vous donne accès à :

• la création de factures personnalisées à votre image ;
• la centralisation des factures clients et fournisseurs ;
• la gestion des notes de frais ;
• la synchronisation des comptes bancaires externes.

Le tout dans une interface intuitive.

Les entreprises doivent émettre des factures respectant des normes précises.

Un logiciel de facturation conforme garantit le respect de la réglementation. Par exemple :

• la numérotation chronologique ;
• la présence des mentions légales obligatoires ;
• l’archivage sécurisé des documents.

Attention : Sauf exceptions, les entreprises assujetties à la TVA ayant des clients particuliers doivent choisir un logiciel de caisse respectant la loi anti-fraude à la TVA dès lors qu’ils en utilisent un.

Par ailleurs, la nouvelle réforme de facturation électronique obligatoire entrera bientôt en vigueur. Elle concernera toutes les entreprises françaises assujetties à la TVA et opérant auprès de clients professionnels (BtoB) français.

Dès le 1er septembre 2026, toutes les entreprises concernées devront être en mesure de recevoir des e-factures. Par ailleurs, les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire (ETI) auront également l’obligation de transmettre des factures clients électroniques.

Au 1er septembre 2027, cette nouvelle règle touchera le reste des entreprises.

D’où l’importance de choisir dès aujourd’hui un logiciel de facturation électronique conforme avec la nouvelle réforme afin d’anticiper les règles à venir.

Qonto Facturation est 100 % conforme à la réforme de facturation électronique.

Qonto est même devenue une Plateforme Agréée par l’État.

La plupart des logiciels de facturation intègrent un tableau de bord permettant de suivre :

• votre chiffre d’affaires ;
• vos encaissements ;
• vos factures impayées.

Certains se connectent même à vos comptes professionnels pour un suivi de trésorerie en temps réel.

C’est le cas de Qonto Facturation.

Notre solution vous permet de suivre le statut de vos factures en temps réel afin de pouvoir relancer vos clients en un clic en cas de retard de paiement. En effet, vous pourrez connecter tous vos comptes pro à notre interface.

Elle centralise également vos factures fournisseurs pour pouvoir garder un œil sur vos échéances.

Pour aller plus loin dans l’optimisation de votre trésorerie, essayez gratuitement notre solution de cash management.

Les factures générées via un logiciel peuvent être plus facilement exportées vers votre cabinet comptable.

C’est un vrai plus pour fluidifier les échanges et éviter les erreurs de saisie.

Afin de simplifier vos opérations de pré-comptabilité, le logiciel de facturation de Qonto vous donne la possibilité de centraliser toutes vos factures et justificatifs sur sa plateforme.

Ainsi, vous profiterez du rapprochement automatique de chaque facture avec la transaction correspondante.

De plus, notre outil détecte automatiquement les données clés de vos factures.

Avec un compte pro Qonto, vous bénéficierez aussi d’un accès comptable dédié.

Le marché regorge d’outils, des plus simples aux plus complets. Voici un comparatif de six logiciels de facturation appréciés par les indépendants, les TPE et les PME. À savoir :

• Qonto ;
• Henrri ;
• Facture.net ;
• Vosfactures ;
• Abby ;
• Tiime.

Connu pour son compte professionnel rémunéré, Qonto propose aussi un outil de facturation gratuit. Il est disponible avec ou sans compte pro.

Ses points forts :

• conformité avec la réforme de facturation électronique et Plateforme Agréée par l’État ;
• création et envoi de devis et de factures personnalisés en illimité ;
• suivi du statut des factures en temps réel grâce à la connexion à vos comptes pro ;
• relance automatique en un clic en cas de retard ;
• centralisation de vos factures fournisseurs et de vos justificatifs pour avoir une vision globale des échéances à venir ;
• édition des notes de frais ;
• suivi de trésorerie ;
• rapprochement automatique des factures et des transactions.

C’est un excellent choix pour ceux qui veulent une solution fluide, conforme et sans frais supplémentaires.

Vous profitez de fonctionnalités supplémentaires dès lors que vous avez un compte pro Qonto, telles que des cartes de paiement 100 % paramétrables, une rémunération de vos soldes pouvant atteindre 4 %, un accès comptable dédié et plus de 2 000 intégrations.

Notre solution est à la fois un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur, pour freelance ou pour les PME souhaitant centraliser la gestion de leur trésorerie et de leur facturation.

Henrri est un logiciel qui donne accès à toutes ses fonctionnalités de base gratuitement. À savoir :

• l’édition de devis et de factures électroniques ;
• la gestion des clients ;
• le suivi des paiements :
• la relance des impayés ;
• la validation des devis en ligne ;
• la gestion des acomptes ;
• le paiement des factures en ligne et par mobile ;
• un accès comptable.

En revanche, il est nécessaire de vous tourner vers les formules payantes (de 17 à 550 € HT par mois) pour pouvoir effectuer des factures sans TVA, des factures d’avancement ou des factures récurrentes, et profiter d’outils de pilotage d’entreprise.

Ce logiciel de facturation électronique s’adresse aux indépendants, aux artisans et aux PME cherchant un outil simple et conforme.

Facture.net es un outil de facturation électronique en ligne gratuit qui combine CRM et gestion commerciale. Ses avantages :

• création rapide de devis et de factures en illimité ;
• gestion des clients et suivi commercial ;
• intégration d’un lien de paiement sur vos factures ;
• gestion des encaissements en temps réel ;
• création d’un site vitrine gratuit.

Cet outil séduit les entreprises souhaitant un outil polyvalent regroupant facturation et gestion de la relation client, sans payer un centime.

Très complet, Vosfactures est un logiciel de facturation en ligne multifonction.

Il propose une formule gratuite qui ressemble davantage à un essai puisqu’elle est limitée à trois documents de facturation par mois.

En revanche, vous avez accès à de nombreuses fonctions essentielles à partir du forfait basique à 5 € HT par mois. Par exemple :

• la création de factures personnalisées en illimité et dans plus de 30 langues ;
• la gestion des taxes, des réductions et des acomptes ;
• la constitution d’un catalogue produits avec gestion des ruptures de stock ;
• le suivi des paiements et les relances en cas d’impayés ;
• la gestion des contacts ;
• l’obtention de rapports financiers ;
• la gestion des dépenses et des notes de frais ;
• un accès comptable ;
• une application mobile de devis et de factures.

Les formules supérieures incluent davantage d’outils de personnalisation, de paiement, de suivi comptable et de gestion de stock.

Ce logiciel convient particulièrement aux PME en croissance qui ont besoin d’un outil tout-en-un pour piloter à la fois la facturation, la gestion commerciale et la comptabilité.

Abby est un logiciel de facturation et de comptabilité développé pour les indépendants.

Sa formule gratuite propose tous les éléments de base de la facturation, dont :

• l’édition et l’envoi de factures électroniques ;
• la création d’un répertoire clients et d’une bibliothèque d’articles ;
• des outils de comptabilité (livre des recettes, registre des achats, etc.).

Les forfaits payants sont plus complets et attractifs pour allier facturation, comptabilité et suivi de productivité. Ils intègrent notamment l’avance de crédit d’impôt, la gestion des stocks, les factures en langues et devises étrangères et la réalisation de vos déclarations d’impôts.

Tiime s’impose comme une référence pour les entrepreneurs souhaitant une application de facturation et de comptabilité.

Les points forts de son forfait gratuit sont :

• la facturation personnalisée en illimité et conforme avec la réforme à venir ;
• le suivi du statut des devis et des factures ;
• la réception de vos e-factures fournisseurs ;
• la présence d’un tableau de bord de suivi du chiffre d’affaires ;
• l’export des factures ;
• une application mobile.

Les formules payantes transforment cette solution en outil tout-en-un avec la signature électronique des devis, la réalisation de notes de frais, le pilotage de la trésorerie en temps réel et l’obtention d’un compte pro.

Le meilleur logiciel de facturation est celui qui correspond à votre profil et à vos besoins réels. Avant de choisir, prenez en considération les critères suivants :

• les fonctionnalités proposées ;
• la facilité d’utilisation ;
• les intégrations ;
• la sécurité et la conformité ;
• le coût.

Tous les logiciels proposent généralement les fonctionnalités essentielles liées à la facturation, telles que :

• la création de devis et de factures ;
• le suivi des règlements ;
• l’archivage ;
• la relance des impayés.

Toutefois, ils se différencient sur la personnalisation offerte des factures et sur des outils plus avancés. Par exemple, l’export comptable, la prise en compte des devises étrangères, la centralisation des factures fournisseurs, le paiement en ligne ou encore la gestion du stock.

Un bon outil doit être intuitif.

Vous devez pouvoir créer une facture rapidement, sans formalités complexes.

La disponibilité d’une application mobile peut aussi faire la différence pour les professionnels nomades.

Un avantage au quotidien est la compatibilité du logiciel avec vos outils : votre compte pro, votre solution de comptabilité, votre CRM, etc.

Avoir des logiciels connectés est un vrai gain de productivité.

Le logiciel choisi aura accès à des données confidentielles de votre entreprise. Assurez-vous qu’il :

• stocke vos informations sur des serveurs sécurisés ;
• respecte la loi anti-fraude à la TVA en fonction de votre activité ;
• sera compatible avec la facturation électronique.

Le petit plus qui fait la différence : un logiciel immatriculé Plateforme Agréée. Vous pourrez ainsi remplir toutes vos obligations de facturation électronique sans changer vos habitudes.

Certains outils sont gratuits, d’autres fonctionnent sur abonnement mensuel ou annuel.

Pensez à comparer le rapport qualité-prix et évitez de payer pour des services que vous avez déjà avec un autre logiciel.

Un logiciel de facturation n’est pas seulement un outil administratif. C’est un levier de productivité, de conformité et de pilotage financier.

Qonto Facturation est un logiciel de facturation électronique et une Plateforme Agréée qui vous simplifie le quotidien avec de nombreuses fonctionnalités de facturation, de suivi de trésorerie et de pré-comptabilité.

Vous avez le choix entre son utilisation 100 % gratuite sans compte pro et son intégration à votre compte pro Qonto pour profiter davantage d’outils pensés pour les entrepreneurs afin de vous faire gagner en productivité (compte pro rémunéré, plus de 2 000 intégrations, etc.).

Les informations mentionnées dans cet article sur la comparaison des logiciels de facturation ont été rassemblées après une recherche approfondie sur les sites web des fournisseurs respectifs en novembre 2025 et en toute bonne foi. Qonto n'est pas responsable de l'exactitude complète de toutes les informations, car les prix et les services peuvent changer au fil du temps. Nous faisons de notre mieux pour que toutes les informations soient toujours à jour. Nous vous invitons toutefois à vous informer par vous-même avant de prendre une décision finale.

Le compte pro rémunéré de Qonto n’est pas un compte bancaire, ni un produit d’investissement ou d’épargne. En tant qu’établissement de paiement, Qonto propose des comptes de paiement, tels que définis aux articles L314-1 I et L522-4 du Code monétaire et financier. La rémunération du compte de paiement Qonto n’est pas un service de paiement, mais une promotion commerciale pour récompenser les entreprises qui l'utilisent au quotidien, ainsi que les divers services associés.