Comparatif des Plateformes Agréées : quelle solution choisir en 2026 ?

À partir du 1er septembre 2026, toutes les entreprises françaises assujetties à la TVA devront être en mesure de recevoir des factures électroniques. Pour répondre à cette obligation, elles devront s’appuyer sur une Plateforme Agréée ou une solution compatible. Découvrez notre comparatif des Plateformes Agréées, ainsi que nos conseils sur les éléments clés à analyser pour sélectionner la solution adaptée à votre entreprise.

Gratuites ou Payantes, les Plateformes Agréées (PA) jouent un rôle central dans la réforme de la facturation électronique.

Une Plateforme Agréée est un opérateur privé habilité par l’État à intervenir dans le cadre de la réforme de la facturation électronique.

Son rôle consiste notamment à :

• émettre des factures dans un format structuré (Factur-X, UBL, CII) ;
• transmettre les e-factures à la PA des clients, après consultation de l’Annuaire central ;
• réceptionner les e-factures fournisseurs ;
• assurer la transmission des informations nécessaires à l’administration fiscale ;
• archiver les factures pendant 10 ans.

Leur objectif est de garantir des échanges sécurisés, standardisés et conformes aux nouvelles obligations réglementaires.

Le coût d’une Plateforme Agréée varie fortement en fonction des fonctionnalités proposées. Certaines solutions proposent une offre gratuite (ou incluse dans un écosystème plus large), tandis que d’autres sont payantes.

Qonto a fait le choix de mettre à disposition des entrepreneurs un logiciel de facturation électronique 100 % gratuit.

Avec ou sans compte pro, vous pourrez envoyer et recevoir des factures électroniques en illimité.

Découvrez un aperçu des fonctionnalités et conditions tarifaires des principales Plateformes Agréées sur le marché.

Toutes les Plateformes Agréées ne s’adressent pas aux mêmes entreprises. Certaines privilégient la facturation électronique seule, tandis que d’autres proposent des solutions tout-en-un.

Découvrez les principales PA disponibles actuellement :

• Qonto ;
• Agicap ;
• Pennylane ;
• Sage ;
• Cegid ;
• Tiime ;
• Sellsy ;
• Indy ;
• Axonaut ;
• Yooz.

Qonto Facturation est une Plateforme Agréée gratuite qui combine facturation électronique, gestion des dépenses, agrégation bancaire et pré-comptabilité au sein d’une interface unique.

Points forts :

• création de factures à votre image ;
• suivi du statut de vos factures en temps réel ;
• relance en un clic ;
• centralisation de toutes vos factures ;
• détection automatique des données de facturation ;
• édition des notes de frais ;
• synchronisation bancaire avec rapprochement automatique des factures aux transactions correspondantes ;
• tableau de bord de suivi de trésorerie.

À partir de seulement 9 € HT par mois, vous pouvez transformer cet outil en solution tout-en-un de gestion financière avec un compte pro avec découvert autorisé, la gestion de trésorerie, l’automatisation de votre pré-comptabilité et des outils pour maîtriser les dépenses d’équipe.

Agicap est un logiciel de gestion de trésorerie adapté aux PME et ETI.

Afin de compléter son offre, il est devenu une PA qui s’intègre naturellement dans son outil.

Points forts :

• prise en charge des trois formats réglementaires (Factur-X, UBL et CII) ;
• archivage à valeur probante de 10 ans ;
• transmission des données de e-reporting ;
• fiabilisation de vos prévisions de trésorerie ;
• automatisation des processus d’achat (cycles d’approbation, saisie comptable, paiement des fournisseurs, suivi des budgets, etc.) ;
• recouvrement automatique suivant les plans de relance définis.

Pennylane est une plateforme tout-en-un associant facturation, pilotage financier, comptabilité et compte pro.

Sa PA est disponible dès sa formule Basique à 14 € HT par mois pour les indépendants.

Points forts :

• facturation électronique ;
• gestion des achats avec planification des paiements ;
• compte pro avec financement des factures fournisseurs et avance de trésorerie ;
• analyse des finances ;
• collaboration comptable facilitée.

Sage fait partie des acteurs historiques des solutions de gestion d’entreprise et de comptabilité.

Son offre couvre les besoins des TPE, PME et structures plus importantes à travers plusieurs logiciels.

Tous ses produits de facturation électronique intègrent la PA Sage.

À titre d’exemple, Sage Active est une solution qui allie facturation, comptabilité, paie et RH en ligne pour les entreprises de 2 à 20 salariés (à partir de 20 € HT par mois). Elle intègre la possibilité d’envoyer et de recevoir 300 e-factures par mois.

Points forts :

• large gamme de logiciels adaptés à toutes les tailles de sociétés combinant comptabilité, gestion commerciale, paie, RH et gestion d’entreprise ;
• données de facturation centralisées au sein d’une seule interface pour une information financière cohérente ;
• gestion unifiée grâce à l’intégration de la PA aux autres outils de gestion.

Cegid propose des logiciels destinés à tous les types de société. Selon l’outil choisi, ils peuvent couvrir la gestion d’entreprise, l’expertise comptable, le retail et fashion, la finance et fiscalité, les ressources humaines et paie.

Cegid vous accompagne dans la digitalisation de vos processus financiers et comptables en vous proposant sa propre PA, intégrée à ses solutions.

À titre d’exemple, Cegid Business Option Devis & Factures allie gestion des dépenses, suivi en temps réel des indicateurs financiers, collaboration comptable, agents IA et facturation clients.

Points Forts :

• PA intégrée dans les logiciels de gestion de Cegid ;
• large gamme de solutions : du logiciel de gestion pour TPE à l’ERP pour grandes entreprises ;
• produits adaptés à chaque secteur d’activité.

Tiime est un logiciel de facturation électronique gratuit particulièrement apprécié des indépendants et des petites entreprises.

En option, il peut combiner comptabilité et compte pro en plus (à partir de 17.99 € HT par mois).

Points forts :

• facturation électronique gratuite avec suivi des performances en temps réel ;
• collaboration comptable incluse.

Sellsy est une solution française orientée gestion commerciale et relation client.

Son offre Standard accessible à partir de 29 € HT par mois et par utilisateur intègre sa PA. Elle peut être combinée avec son logiciel de vente et ses modules complémentaires Trésorerie et Marketing.

Points forts :

• facturation électronique avec suivi d’activité, gestion des achats et des marges, relance automatique, signature électronique, paiement en ligne, rapprochement bancaire ;
• pré-comptabilité incluse ;
• nombreuses automatisations ;
• accès expert-comptable ;
• offre évolutive.

Indy est avant tout un logiciel de comptabilité destiné aux indépendants et aux petites structures. Toutefois, il s’est développé pour intégrer la création d’entreprise, la gestion des paiements et des déclarations fiscales, et la facturation électronique.

Sa PA est incluse dans tous ses forfaits, y compris dans la formule gratuite.

Points forts :

• facturation électronique illimitée avec suivi automatique des paiements et acquittement des factures, gestion des frais de débours, archivage et rapprochement bancaire ;
• comptabilité et pilotage d’entreprise ;
• réalisation de vos déclarations obligatoires (payante) ;
• compte pro inclus.

Axonaut est un logiciel de gestion d’entreprise qui combine un grand nombre de fonctionnalités au sein d’une même interface. Dernièrement, il a été immatriculé PA par l’administration fiscale.

Il est accessible à partir de 38,80 € HT par mois (sous condition d’engagement de 3 ans).

Points forts :

• facturation électronique illimitée, avec relance automatique, recouvrement d’impayés par commissaire de justice, paiement des factures en ligne, analyse par IA et avance de trésorerie ;
• solution ultra complète avec facturation, CRM, compte pro, gestion des dépenses, du stock, de la comptabilité et de la trésorerie, suivi des projets, RH et marketing.

Yooz est une solution de facturation électronique boostée par l’IA.

Disponible à partir de 99 € par mois, il se démarque grâce à ses nombreuses automatisations.

Points forts :

• centralisation du traitement de toutes les factures émises et reçues ;
• chat collaboratif client - fournisseur ;
• circuits intelligents de validation ;
• génération automatique des écritures de vente et des commandes fournisseurs ;
• rapprochement intelligent ligne par ligne ;
• solution de paiement automatisée ;
• intégration ERP, CRM, GED, etc. ;
• prévention de la fraude et détection intelligente.

Le choix d’une Plateforme Agréée ne doit pas se limiter à une comparaison des tarifs. La solution retenue devra s’intégrer dans les processus de l’entreprise et accompagner ses besoins à long terme.

Avant de faire votre sélection, identifiez :

• les fonctionnalités requises ;
• votre budget ;
• la qualité du support client de la PA ;
• sa compatibilité avec l’écosystème de votre entreprise.

Toutes les entreprises n’ont pas les mêmes attentes en matière de facturation électronique et de logiciel de gestion. C’est pourquoi certaines plateformes sont conçues pour les auto-entrepreneurs et d’autres pour les grandes entreprises.

Un indépendant qui émet quelques factures par mois n’aura pas besoin d’un ERP ultra complet.

Avant de comparer les solutions, il est donc utile d’identifier :

• le volume de factures à traiter ;
• le nombre d’utilisateurs ;
• le niveau d’automatisation souhaité ;
• les besoins en matière de facturation, gestion des dépenses, comptabilité, relation client, etc. ;
• les intégrations souhaitées.

Cette étape permet d’écarter rapidement les PA qui ne correspondent pas aux besoins de votre activité.

Les PA proposent des modèles tarifaires très différents : de la formule gratuite à l’intégration dans une suite de logiciels de gestion à une centaine d’euros par mois.

Au-delà du prix affiché, il est recommandé d’évaluer :

• les éventuels frais de mise en place ;
• les fonctionnalités incluses ;
• les options payantes ;
• les limitations de certaines offres.

Il est important d’estimer le rapport qualité/prix et le gain de temps que peut vous apporter une bonne PA.

La mise en place de la facturation électronique soulève de nombreuses questions techniques et organisationnelles lors du déploiement d’un nouvel outil.

Il peut être pertinent de vérifier :

• les horaires de disponibilité du support client ;
• les canaux de contact proposés ;
• l’existence d’une documentation.

Un accompagnement de qualité peut faciliter la prise en main de l’outil et son adoption.

Pour être efficace, la facturation électronique doit s’intégrer dans votre environnement de travail.

Vous pouvez choisir un outil tout-en-un pour centraliser toutes vos informations dans une seule interface ou vérifier la capacité de la PA à communiquer avec vos logiciels (comptable, ERP, CRM, etc.).

Une bonne intégration permet de limiter les ressaisies, de réduire les erreurs et d’automatiser davantage les processus administratifs.

L’administration fiscale met à disposition sur son site la liste des Plateformes Agréées autorisées à intervenir dans le cadre de la réforme de la facturation électronique.

Elle est régulièrement mise à jour afin de tenir compte des nouvelles PA habilitées.

Qonto fait partie de la liste officielle des Plateformes Agréées par l’État.

Qonto vous offre le choix entre sa PA gratuite et déjà riche en fonctionnalités (gestion des dépenses, suivi et rapprochement automatique, centralisation des factures, etc.) et sa solution de gestion complète.

Cette dernière vous permet de combiner facturation électronique, gestion de trésorerie, automatisation de la pré-comptabilité, contrôle des dépenses d’équipe et compte pro innovant dans une seule interface intuitive.

Anticipez dès maintenant la réforme de septembre 2026. En effet, il faut généralement quelques mois pour être 100 % opérationnel entre le choix de l’outil, sa configuration, sa prise en main et la formation des équipes.

Qonto est d’ores et déjà prêt pour vous accompagner dans une transition fluide.

Les informations mentionnées dans cet article sur la comparaison des Plateformes Agréées ont été rassemblées après une recherche approfondie sur les sites web des fournisseurs respectifs en juin 2026 et en toute bonne foi. Qonto n'est pas responsable de l'exactitude complète de toutes les informations, car les prix et les services peuvent changer au fil du temps. Nous faisons de notre mieux pour que toutes les informations soient toujours à jour. Nous vous invitons toutefois à vous informer par vous-même avant de prendre une décision finale.